在林嘉的指引下，林深找到实验室最深处的密码门，输入自己的生日，门后是堆满医疗设备的房间，床上躺着戴着眼罩的女人。当他摘下眼罩，对上的是和林嘉、“镜”一模一样的面容——但眼角的疤痕，分明是记忆中母亲的特征。
“小深，对不起……”母亲的手颤抖着抚过他的脸颊，“当年我和你父亲参与‘银蓝’计划，是为了治疗你哥哥的先天性心脏病，没想到军方想把它变成控制人类的武器。你姐姐和哥哥被植入了记忆读取芯片，而你……”她咳嗽着指向墙上的照片，三个婴儿旁边站着年轻的周明轩母亲，“你们四个才是真正的‘四叶三叶草’，缺一不可。”
结尾：终极抉择
城市中心的钟楼突然响起十二声轰鸣，蓝色雾气在瞬间凝结成千万片冰晶，悬浮在半空组成巨大的全息投影。周明轩的声音从四面八方传来：“现在，林深，你有两个选择——用你的脑脊液激活‘镜’，让我们四人融合，启动记忆重置，所有人都会忘记痛苦的过去；或者看着‘银蓝’失控，让这个充满谎言的世界，彻底崩塌在记忆的废墟里。”
林嘉和“镜”同时伸出手，掌心的三叶草刺青发出共鸣般的蓝光。母亲的监测仪突然发出警报，她的瞳孔里开始浮现代码，和那些被雾气感染的人一样。林深望向窗外，看见江野正举着枪保护平民，而远处的天空，已被染成了不祥的钴蓝色。
他忽然想起父亲日记的最后一行，被他忽略的半句：“如果有一天小深必须做选择，就让他跟着心走——因为他才是‘银蓝’的真正宿主，而爱，是唯一能破解代码的密钥。”
当林深将手同时放在林嘉和“镜”掌心时，整个实验室剧烈震动，培养舱里的液体突然化作蓝色蝴蝶，冲破玻璃窗飞向城市各处。周明轩的笑容第一次出现裂痕，他看着自己逐渐透明的手掌，惊呼：“你做了什么？这不是记忆重置程序！”
“我只是让每个人都找回了属于自己的记忆。”林深望向母亲逐渐湿润的眼眶，“包括你，周明轩——你其实早就知道，你母亲当年为了保护我们，死在了那场爆炸里，而你一直戴着的祖母绿袖扣，是她留给你的最后礼物。”
蓝色蝴蝶掠过的地方，所有被雾气感染的人都缓缓跪下，眼中的代码化作泪水流淌。林嘉抱住“镜”，两个女孩在蓝光中渐渐重合，变成一个完整的身影。周明轩踉跄着后退，撞在培养舱上，忽然笑了，带着解脱的哭腔：“原来，妈妈从来没有抛弃我……”
城市上空的冰晶开始融化，化作细雨飘落。林深站在实验室中央，看着墙上逐渐浮现的新文字，那是父亲用蓝墨水写下的最终留言：“当三叶草盛开时，记忆的囚笼会被爱打破。记住，你们不是实验体，是爸爸妈妈最珍贵的孩子。”
