知道无法打退登上自己旗舰的明军，科恩不得不非常沮丧的下令。
“全体弃舰！转移至科隆号！”
科恩的命令在巴达维亚号的甲板上回荡，他的声音中带着一种罕见的恐慌与不甘。
副舰长彼得愣了一下，随后反应过来，连忙组织亲卫护送科恩往船头一侧放下的小艇奔去。他原以为总督会在新的旗舰上重整旗鼓，与明军决一死战，但哪知道登上科隆号的科恩接下来的第一条命令就让他心头一沉。
“传令各舰，分散突围！能走多少走多少！”登上科隆号的科恩喘息未定，便急促下令，“科隆号全速向东，绕开明军主力！”
“总督阁下，我们……”彼得还想说什么。
“闭嘴！执行命令！”科恩怒吼，双眼布满血丝，“你想死在这里吗？看看海面上！”
彼得顺着他的手指望去，只见至少已有四艘明军快船正全速向科隆号追来，而更远处，明军主力舰队正调整阵型，准备全面追击。
科隆号率先调转船头，升起满帆，破开波涛向东疾驰。这一举动在荷兰舰队中引发了更大的混乱——旗舰率先逃跑，意味着这场海战已经彻底失败。
“红毛鬼要跑！”沈有容在“镇海”号舰桥上看得分明，当即下令，“全军追击！不要放走一艘敌舰！”
福广水师的十艘主力舰升起满帆，如猎豹般扑向溃逃的荷兰舰队。而那些小型快船更加灵活，已经咬住了几艘落后的荷兰武装商船。
海面上演了一场猫捉老鼠的追逐战。荷兰舰船各自逃命，队形彻底瓦解，有的向南，有的向北，更多的是跟着科隆号向东逃窜。
“军门，敌军分散突围，我军兵力有限，恐难以全歼。”颜思齐通过旗语传来担忧。
沈有容眉头紧锁。他自然明白这个道理，荷兰舰队虽遭重创，但仍有三十余艘舰船，若四散奔逃，以福广水师的数量确实难以全部拦截。
就在此时，了望哨突然高喊：“军门！西北方向发现船队！数量众多！”
沈有容连忙举起望远镜，只见西北海平线上，一支庞大的舰队正破浪而来。为首的是一艘与“镇海”号同级的三桅大舰，船头飘扬着大明龙旗和“孙”字将旗。
“是孙军马！”沈有容大喜，“援军到了！传令各舰，全力追击！孙军马的舰队会从西北方向包抄！”
孙元化率领的三十艘战舰加入战场，彻底改变了力量对比。这支从南京水师抽调的精锐舰队训练有素，船型统一，速度极快。
“分三队包抄！一队截断东逃路线，二队追击南逃敌舰，三队配合沈军门围剿残敌！”孙元化在旗舰“定海”号上迅速下令，他通过望远镜已看清战场形势。
明军舰队如同张开的大网，从三个方向合围溃逃的荷兰舰队。
科恩在科隆号上看到这一幕，脸色更加苍白。“上帝啊……他们还有援军……”
“总督阁下，东北方向也有明军舰船包抄过来！”了望手惊恐报告。
“转向东南！全速！”科恩嘶吼，他此刻只有一个念头——逃回巴达维亚。
但东南方向也不安全。袁八老在俘获巴达维亚号后，迅速组织了几艘还能航行的快船，正从那个方向拦截。
“撞上去！不能让红毛总督跑了！”袁八老站在一艘俘获的荷兰快船上，亲自掌舵。这艘船原本是荷兰舰队的通讯船，速度极快。
科隆号在明军包围网中左冲右突，科恩几乎是凭着本能指挥着逃亡路线。他命令三艘武装商船断后，不惜一切代价拖住追兵。
那三艘商船上的荷兰水手知道已是必死之局，反而爆发出惊人的战斗力。他们调转船头，迎着明军追兵冲去，企图用自杀式冲击为旗舰赢得时间。
“放火船！撞沉他们！”孙元化冷静下令。
六艘明军火攻船冲向三艘断后的荷兰商船。海面上爆发出三团巨大的火球，浓烟滚滚。这三艘商船以自毁为代价，确实拖住了明军的部分追兵。
科恩利用这宝贵的时间，命令科隆号和另外四艘幸存的舰船全速冲出包围圈。他们选择的路线十分刁钻，从两支明军分队的缝隙中穿了过去。
