司法部以后查案和审案将会分开，查需要完善证据链，审也需要按律法判定，不能随意按个人喜好判定。
衙役改为地方治安队，只负责当地治安，要是治安出问题，治安队负责人担负责任。
最后一个更为重要，就是律法部，只负责修订和制定法律。
朱由检没有下场，而是让他教出来的这三百多人，按计划中的部门划分出来，各自按自己擅长的一面划分到各自部门，
当然，锦衣卫也被改革，改成了监察部，负责监察各地，以后没有了执行权，只有监察权。
但是可以暗中探查收集证据和情报等，监察各地。
执行给到了司法部那边。
这是以后各部门正常运行后开始，现在特殊时期，以皇上旨意为准。
“陛下，部门已经划分完成。”
“不错，先行在京城试运行，找出漏洞，日后时机成熟再扩展全国。”
朱由检也不会傻到现在就开始执行。
只有等他掌握全部军队，改革完军队，新武器装备自己能掌控的军队后，再一个省一个省的横推过去。
他没心力去和这个时代的读书人去勾心斗角。
能做到一方父母官的，那个是简单的，政治这东西，很简单也很复杂，简单是只要势力足够，就可一言而定，不然只能在政治上你死我活中斗争求胜。
偏偏朱由检最为不擅长的就是这种斗争，所以选择一力降十会。
“陛下，我等二十人觉得留在智囊团，为陛下出谋划策为好，不想为官。”
“准了，你们以后就做朕的智囊团，为朕推演时局和全国局势和解决之法。”
“谢陛下恩准。”
“魏忠贤，朕需要你和锦衣卫配合，清洗辽东边军，特别是那些暗中放开边关与后金走私的人，孙传庭在那边已经开始，让你们下面的人全力配合，朕需要一个干净稳定的辽东。”
“遵旨。”骆养性和魏忠贤连忙跪下接旨。
“平身吧，别动不动就跪，魏忠贤，你亲自带人去解决晋商，至于为什么，想必你比朕清楚。”
“遵旨，老奴明天就出发。”
“骆养性，让锦衣卫动起来，京城仍需要再清理，不管勋贵还是以前退下大臣，都在清查范围。”
“遵旨。”
“大伴，你也带着新军，去再次清理京营，让新军队长对他们重新整治，一个月后朕要见到新的京营。”
“陛下，那些勋贵子弟？”
“该怎么处置就怎么处置，他们现在翻不了天，不过，没有违法的也可以留下，以前克扣军饷的，都处理了，该抄家还是要抄家，证据你那里想必已经有了。”
“遵旨。”
“就这样吧，退朝。”
原来暗中的小朝廷，现在终于放到明面上来了。
朱由检离开了，可是没有被清算道的大臣此刻已经懵逼在原地，看着眼前几百个年轻人，每一个都充满了活力，而且井然有序。
他们太年轻了，看起来还是个孩子。
朱由检明白，所以只是让他们在京城试试他们的本事，毕竟确实还是太年轻，只要能维持京城稳定就可以了。
