虚空大帝覆灭后，联盟并未满足于元初文明母星的战场胜利。通过对虚空教团残余势力的审讯和战场数据的分析，林雨柔的情报团队发现，虚空教团在多元宇宙的多个区域仍有隐藏据点：星空中的三座残余舰队集结点、元初文明母星地下的两座虚空能量加工厂、时空夹缝中的一处核心补给站。这些据点如同毒瘤，若不及时清除，随时可能死灰复燃，威胁多元宇宙的和平。
张川立刻召开军事会议，制定 “多线纵深打击计划”：“联盟将兵分五路，同时对所有虚空据点发起攻击，不给敌人任何喘息和集结的机会！第一路，由雷克斯率领星刃舰队和机械宇宙的雷霆分队，攻击星空中的‘阿尔法集结点’，摧毁残余主力舰队；第二路，由莫尔带领暗影族和时空守护者，潜入‘贝塔集结点’，利用潜行和时空技术，精准打击指挥中枢；第三路，由赵灵儿带领灵能机甲部队和绿野族的支援分队，攻克地下的两座能量加工厂，切断敌人的能量补给；第四路，由凌霜率领时空穿梭舰队，突袭时空夹缝中的‘伽马补给站’，拦截所有战略物资；第五路，由我和苏婉儿率领圣光舰队的核心力量，作为机动支援部队，随时驰援各条战线，确保万无一失。”
“后勤保障同步跟进！” 林雨柔补充道，“各战线配备移动后勤枢纽，通过时空跳跃节点输送弹药和医疗物资；科研团队已升级‘虚空追踪仪’，能实时定位敌人的能量波动，为各部队提供精准导航；所有攻击部队均配备最新的‘虚空净化弹’，可快速清除据点内的虚空能量残留。”
五路部队在三小时内完成集结，按照预定计划向目标据点推进。雷克斯的第一路部队率先抵达阿尔法集结点，这里盘踞着虚空教团的三千艘残余战舰，虽然数量不及巅峰时期，但其中包含五十艘搭载了简化版超级虚空炮的中型战舰，战力不容小觑。
“星刃舰队，左翼展开！雷霆分队，右翼迂回！” 雷克斯下令，星刃舰队的八百艘战舰释放出银色星刃能量，形成密集的火力网，正面吸引敌人注意力；机械宇宙的五百艘雷霆战舰则借助高速引擎，绕至敌人侧翼，超级虚空炮精准锁定敌人的中型战舰。“开火！” 两道火力网交织，敌人的战舰如同脆弱的纸鸢，在法则能量与机械炮火的双重打击下纷纷爆炸，五十艘中型战舰在十分钟内被全部摧毁，残余的小型战舰陷入混乱，开始四散逃窜。
“追击残敌，不留死角！” 雷克斯驾驶星刃机甲，亲自冲在最前方，星刃长剑劈出一道千米长的能量刃，将一艘试图突围的旗舰劈成两半。第一路部队仅用两小时就彻底摧毁阿尔法集结点，歼灭虚空战舰两千八百余艘，俘虏三百余人，自身仅损失战舰二十七艘，战损比不足 1:100。
与此同时，莫尔的第二路部队已潜入贝塔集结点。这座集结点隐藏在一片陨石带中，战舰密集排列，外围布置了虚空能量干扰场，常规探测设备无法穿透。暗影族的战士们激活 “暗影同化” 技能，身体融入陨石阴影，悄无声息地靠近敌人的防御屏障；时空守护者则释放 “时空褶皱”，将干扰场的能量波动暂时扭曲，为潜入创造通道。
“目标：指挥舰的通讯核心！” 莫尔的暗影机甲如同幽灵般穿过防御屏障，带领二十名精锐战士潜入敌人的旗舰。旗舰内的虚空守卫虽有察觉，但暗影族的速度远超他们反应，暗影能量刃精准切割守卫的喉咙，时空守护者则用时空冻结技能封锁走廊，避免警报扩散。三分钟后，通讯核心被成功摧毁，贝塔集结点的战舰失去指挥，如同无头苍蝇般乱撞。
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