公元前490年9月12日，马拉松战役打响了。波斯人看到希腊士兵少，根本没放在眼里，觉得“一波冲锋就能搞定”。可没想到，希腊人在米太亚得的指挥下，故意把中间的阵型拉薄，把精锐放在两翼，等波斯人冲过来时，中间的士兵先假装后退，引诱波斯大军往中间挤；等波斯人阵型乱了，希腊两翼的精锐立马拿着长矛冲锋，像两把尖刀一样扎进波斯军队的两侧，把波斯人包了“饺子”。
波斯士兵从没见过这种打法，原本松散的队伍瞬间被冲垮，士兵们只顾着往海边的战船跑，希腊人在后面追着砍，波斯人的战船挤在海边，有的还没来得及开船就被希腊人点燃，海面上满是惨叫和燃烧的船板。这场仗打下来，波斯人死了6400多人，而希腊人只损失了192人——这种“以少胜多”的战绩，在当时简直是“奇迹”。
战役结束后，雅典人最关心的是“城里的人能不能尽快知道胜利的消息”。一个叫斐里庇得斯的士兵自告奋勇，从马拉松平原往雅典跑——这段路大概42公里，他一路没停，跑到雅典广场时，只喊出一句“我们胜利了！”就累得倒地而亡。后来人们为了纪念他，就有了“马拉松长跑”这个项目（不过现在的马拉松距离是后来调整的，比当时略长）。
大流士的第一次远征，就这么以“惨败”收场。对希腊人来说，这场胜利意义重大——它打破了“波斯人不可战胜”的神话，让全希腊都知道：只要团结、用对战术，“蛮族”大军也能被打跑；可对大流士来说，这更是“奇耻大辱”，公元前486年，埃及突然再次叛乱，大流士不得不先去平叛，结果在途中病逝。他的儿子薛西斯，接过了父亲的“遗愿 ，带百万大军征讨希腊。
