朱标会意，从容出列。他先是对反对意见表示理解，然后沉稳地开始回应：
“诸位臣工所虑，皆是为国为民，孤与陛下感同身受。”他先定下基调，安抚情绪，随即话锋一转，“然，诸位可知，为何要设格物院？乃因北元遗患未除，边防需更利之火铳；黄河时有泛滥，百姓需更固之堤坝！此皆关乎国本民生！为何要试行李员考选？乃因胥吏无望而生贪墨，朝廷良法美意，往往阻于基层，难以惠及黎民！此弊不除，纵有良种利器，亦如锦衣夜行！”
他接着针对财政问题：“至于钱粮之虑，章程中已有明确。格物院及吏员考选，皆先行试点，范围有限，所需经费，初期由内帑拨付部分，不足者，由相关各部于原有预算内调剂支应，绝不加赋于民！且诸位试想，若格物院真能研发出高效织机，则织造之利可增；若新吏治能减少贪墨损耗，则等于为国库开源！此乃以一时之有限投入，谋长远之巨大回报，绝非纯消耗！”
最后，他强调原则：“陛下已有明训：格物院及杂途吏员，品级不得过高，权责不得僭越，一切需在现有体制框架内运行，绝不动摇科举正途之根本！此次试行，意在查漏补缺，完善制度，若确有不妥，陛下自会下旨叫停。还望诸位臣工，体察圣意，以国事为重，共谋良策，而非固守成见。”
朱标一番话，有理有据，有柔有刚，既阐明了必要性，也回应了核心关切，更亮出了朱元璋的底线。
朱元璋此时方才缓缓开口，声音不高，却带着不容置疑的威严：“太子所言，即是咱意。咱知道，变法维新，从无易事。然，咱更知，固步自封，乃取祸之道！设立格物院，考选专业吏员，非为标新立异，实为巩固国本、惠泽苍生之必需！”
他目光如电，扫过全场：“此事，咱意已决！着即依章程，于京师应天府择地、择衙先行试点！太子总责，吏、工、户三部协同办理，各部堂官需全力配合，不得推诿阻挠！试行期间，有何利弊得失，需及时奏报！退朝！”
言毕，朱元璋起身离去，留下满殿文武，心情复杂。反对者虽心有不甘，但见皇帝意志坚决，太子解释清晰，且限于试点，也只得暂且观望。更多的大臣，则是深深感受到了洪武皇帝那深不可测的布局能力和推动变革的强悍意志，心中敬畏之情更甚，行事也愈发谨慎。
一场朝堂风波，在朱元璋的绝对权威和朱标的妥善应对下，暂时平息。两项重大的制度改革，终于获得了在现实中试水的机会。而朱雄英回到东宫，则开始认真思考，如何为这个看似“缺钱”的大明帝国，找到新的“财源”。帝国的车轮，在争议与权衡中，继续向着未知的前方碾去。
