本来人群都已经被警察疏散了，但是过了一段时间，有人发现西本健也失踪了。
得知消息的柯南等人立马返回。
林无忧之前在去取麻生圭二留下的乐谱时，刻意选了一家民宿，和柯南三人离去的方向相反，之前就和柯南三人道了别，没有给自己留下破绽。
包括之前掐断川岛英夫和黑岩辰次案发现场的线索时，也精准地利用好了时间差，没有留下自己的痕迹。
何况林无忧是个外来者，根本没有任何动机，再加上在柯南的心目中，林无忧又留下了“好人”的印象，所以并没有引起任何柯南的怀疑。
就算柯南怀疑到了凶手可能有帮他搬运尸体的共犯，也绝对不可能怀疑到林无忧头上来，除非林无忧或者浅井成实找柯南自爆，但这显然是不可能的事情。
再说了，林无忧将尸体收入系统空间本身就不可视，就算被人发现他出现在了案发现场，也不能证明他杀了人或者搬运了尸体，只不过这样可能就会被柯南盯着不放了。
柯南到达仓库的时候，原本是应该撞见平田和明袭击村泽周一然后逃跑的。
但是平田和明这个走私那些见不得光的玩意儿的家伙，在刚刚众人离去之后，被林无忧找了个机会干掉了，尸体已经躺在系统空间了。
卖这些货的贩子，人人得而诛之。
所以柯南进入仓库后，发现了西本健的尸体，西本健上吊而亡，脚下有一个垫脚的木箱子，此外还放着打印版的遗书，以及麻生圭二留下来的乐谱。
西本健的尸体当然是林无忧伪造的，遗书也是林无忧放上去的，麻生圭二的乐谱上，关于“成实”的信息也已经被抹去了。
柯南看到了林无忧伪造的遗书，遗书的大意就是承认自己和龟山勇、川岛英夫、黑岩辰次四人伙同麻生圭二走私毒品，并逼死麻生圭二一家的事情，在两年前龟山勇死后，自己单方面认为是麻生圭二的鬼魂作祟，终日愧疚不安，于是决定先杀人再自杀。
柯南觉得这简直就是扯淡，但是又没有足够的线索能够推翻现场的证据。
岛上唯一对当年的真相有了解的，可能会发现乐谱被篡改的69岁的警察同志，也已经躺在林无忧的系统空间了。
目暮警官、毛利小五郎等人赶到现场之后，虽然也觉得这次的几个案件疑点重重，但是同样没有任何新线索，再加上目暮警官接到了来自警视厅的电话，说一名名叫西本健的人将12年前他本人和其他三人的罪行的大量证据用信寄了过来，自首了。
铁证如山，天衣无缝。
所以目暮警官打算收队，草草结案。
柯南见状本来想阻止，但他现在只是个小孩，何况也根本没有足够的理由，所以柯南还是放弃了。
带着一脸颓然之色的柯南又只能找到林无忧：“无忧哥哥，这个案子恐怕是破不了了。”
上次才被自己吓唬了一下，这次又在我面前进入推理状态，简直是记吃不记打，林无忧心里暗想。
不过这次林无忧没说什么，而是“认真”地和柯南讨论起案情：“是啊，我也觉得破不了，我甚至觉得哪怕是我的偶像，福尔摩斯都破不了这个案子。”
“向警视厅发送证据的绝对不是已经死去的西本健，应该就是真凶，而且我怀疑真凶不止一名，至少杀人的一名，将尸体弄走的一名。”
“同时以最后西本健的现场情况来看，凶手的动机就是为了帮12年前被逼死的麻生圭二一家报仇，极大可能是他们的故人。”
林无忧向柯南说出自己的推理，其实他说的都是实话。
柯南点点头，根据现有的线索，即使以他的智商，也只能推理出这么多：“无忧哥哥，我怀疑凶手其实还在岛上，甚至就在那些人之中。”
“但是你现在没有任何线索，也没有任何证据，怀疑也只能是怀疑。”林无忧叹了口气。
“柯南！快点过来，我们要回去咯！”这时，毛利兰的声音传了过来。
毛利兰走到林无忧和柯南面前，向林无忧说道：“林先生，我们要回东京了，你要和我们一起回去吗？”
