《金匮要略》中专门列篇论述疟疾，这部经典对疟疾的阐释十分精要。疟疾的根源是疟邪潜伏在体内，发作有固定的时间规律，表现为寒热交替出现，发作与缓解都有一定的节律。深入探究其中的深奥道理，就能做到辨证精准、治疗细致。
疟疾的种类各有不同，需仔细区分：正疟的寒热症状轻重均衡，按时发作；温疟则发热明显、怕冷较轻，常伴有关节烦热疼痛；寒疟只表现为怕冷而无发热，还会出现身体疼痛、胸部痞闷的症状；瘴疟病情尤为凶险，多因岭南地区的山岚瘴气侵袭所致；牝疟以寒邪偏盛、阳气虚弱为特点，体内还潜伏着痰饮。各种疟疾的症状表现纷繁复杂，需一一辨别。
追究疟疾的病因，主要是疟邪在体内作祟，有时还会夹杂外感的风寒之邪，或兼带暑湿秽浊之气。疟邪盘踞在少阳经，脉象多表现为弦脉，这是其主要特征；若同时有痰饮、食积内阻，还会导致营气与卫气相互损伤。疟邪潜伏在半表半里之间，在营卫之气中往来游走，当正邪相互斗争时，就会引发寒热交替的发作。治疗上，小柴胡汤能调和少阳枢机，是治疗疟疾的基础方剂；白虎加桂枝汤可清热通络，是治疗温疟的有效良方；蜀漆散能祛痰截疟，专治牝疟的寒重症状（服用时需在疟疾未发作前）；柴胡桂姜汤既能调和少阳，又能化解痰饮，对于寒热错杂的疟疾也能有效祛除。
疟疾长期不愈，会导致气血亏虚，还可能形成“疟母”——在胁下结成坚硬不移的肿块。这时可用鳖甲煎丸，起到消散肿块、行气活血的作用，攻克体内积滞；何人饮则能益气养血，通过扶助正气、祛除邪气来截断疟疾的发作。
治疗疟疾需根据病情变化调整方法：要审察寒热症状的轻重多少，辨别气血的盛衰状况；截疟的关键是在疟疾未发作时用药，才能充分发挥药力；治疗顺序上应先治表证、后治里证，根据病情需要选择攻邪或补正的方法。遵从张仲景留下的教诲，就能使疟疾得到治愈。这些治疗方法救助世人、解除病痛，在医学史上留下了重要的功绩。
