二更了，张凤翼在殿内与崇祯皇帝枯站了半夜，抬眼看着这花白头发的崇祯帝，想起家中的长子与陛下年岁正相仿。
“张卿，回吧，今日告假，好好歇息！”
崇祯平淡的说道。
如今崇祯最棘手的问题还是内政还是在这紫禁城！
“微臣告退！”张凤翼张了张嘴，似乎有千言万语，但终究是什么也没说缓缓退下。
内阁、六部及言官体系相互掣肘，议而不决，决而不行，无法应对多线作战（农民军、后金）的危机。
朝廷议事内容常被泄露，导致军事行动失败。
最主要皇权受阻：文官集团（尤其是东林党及其对手）的党争和“清议”常常绑架朝廷决策，使崇祯无法按照自己的意志快速推行政策。至使政令不出文华殿。
他也曾试图改变成立“军机处”，加以改变，迅速将陕西、辽东两地的军情奏报划归其优先处理，试图以“扁平化决策”提升效率。
但这一举措很快遭到文官集团抵制：内阁薛国观以“未经内阁票拟，不合祖制”为由，拒绝在军机处草拟的谕旨上签字；吏部尚书闵洪学则借口“军机处官制未明”，拖延为其拨付办公经费——文官集团的抵制，从军机处诞生的第一天便已开始了。
军机处设立仅半月，吏科给事中刘宗周便成为首个公开发难的文官。二月初十，刘宗周递上《劾军机处疏》，开篇便直指军机处“违祖制、乱纲纪”，称洪武皇帝“废丞相、设内阁，定票拟之制，为万世法”，而崇祯帝设立军机处，“绕内阁而直承天听，是废百余年之成规，开独断专行之先例”。
疏文中，刘宗周重点攻击军机处的人员构成：他痛斥吴孟明“以武夫之身预闻机务，不知经史，不明典制，恐误军国大计”，更弹劾王承恩“以内监入值，违背太祖‘宦官不得干预政事’之铁牌祖训”，直言“东汉十常侍之乱、本朝王振之祸，皆起于宦官干政，今军机处引宦官入局，是蹈覆辙而不悟也”。此外，他还指责军机处“决策不公开、议事无记录”，认为此举会导致“朝堂之上无公论，天下臣民不知政令之所出，恐生流言，动摇人心”。
刘宗周的弹劾，如同投入油锅中的火种，迅速点燃了文官集团的对抗情绪。短短三日内，兵科给事中陈子龙、礼科给事中傅朝佑、御史詹尔选等20余名言官相继上疏，内容与刘宗周如出一辙，均以“维护祖制”“反对宦官干政”“杜绝独夫专制”为核心，形成了“言官集体弹劾”的声势。崇祯帝对此的回应是“留中不发”，既不批准弹劾，也不斥责言官，试图以沉默压制争议，但这种态度反而让文官集团的抵制更加坚定。
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