永历九年夏，长江三角洲的梅雨季节如期而至，潮湿闷热的空气笼罩着新近光复的江南大地。然而，与天气的沉闷形成鲜明对比的，是永历政权内部高涨的士气和迅猛的扩张势头。在南京光复的巨大冲击波和后续强有力的政治军事组合拳下，苏南各府县的收复工作进展神速，但也并非一帆风顺。复杂的局势考验着新政权的智慧和手腕。
这一日，南京皇城武英殿内，朱常沅正与李元胤、沐涵、严起恒等人议事，听取来自各方的最新奏报。好消息络绎不绝，但其中也夹杂着一些亟待解决的难题。
征东将军焦琏派快马送来捷报：“……托监国天威，我军自镇江东下，常州、无锡、江阴等邑，皆望风归附。苏州城清吏，见臣大军压境，内部生变，绿营参将王佐反戈，擒杀清巡抚土国宝，开城迎降。臣已率部入驻苏州，安民已毕，正分兵收取吴江、昆山、常熟等县，苏南大局已定！”
平南将军周谌亦有奏报至：“……臣部已克复芜湖、太平府，当涂县亦降。现兵临宁国府城下，府内清军据城顽抗，然士气低落，破之当在旬日之间。浙江方面，虏巡抚萧起元似有异动，臣已加意防范。”
然而，沐涵掌管的靖安司和都察院，也带来了更为复杂的情报：
“监国，苏松等地虽已光复，然情势复杂。归顺官员中，良莠不齐。有真心归附者，亦有见风使舵，甚至暗通虏廷，预留后路者。如新归附的松江某副将，私下仍与沿海虏党有所勾连。”
“各地绿营降军，数目庞大，安置颇费周章。若处置不当，恐生变乱。”
“更有甚者，太湖周边及部分滨海水域，仍有小股清军残部及海盗水匪活动，劫掠商旅，危害地方。”
朱常沅听罢，沉吟片刻，道：“此乃必然之势。得地易，治地难；收兵易，收心难。当此之时，需刚柔并济，剿抚并用，既显天威，亦施仁政。”他随即做出系列指示：
一、 对已归顺地区，以“抚”为主，迅速建立有效统治。
派员接管，甄别官吏： 朱常沅采纳沐涵建议，从随行文官及南京投诚士子中，选派干练官员为“安抚使”、“巡察御史”，分赴各府县，接管政权，清查府库，并对归顺官员进行严格甄别。对清廉干练、真心归附者，留任乃至升迁；对庸碌无能或心怀异志者，或调离要职，或勒令致仕；对劣迹昭着、民愤极大者，则依法严惩，以儆效尤。
整编降军，强化控制： 严令焦琏、周谌等将领，对投降的清军绿营部队，进行彻底整编。汰弱留强，打散原建制，融入永历军序列，或转为地方守备、屯田部队。军官需集中受训，灌输忠君爱国思想。同时，派遣永历军骨干入驻各要地，确保军事控制权。
减免赋税，收揽民心： 再次明发诏书，重申减免江南地区三年钱粮，严厉禁止各级官府巧立名目、额外加派。由严起恒户部派出干员，督导地方恢复生产，平抑物价，使百姓真正感受到“王师”带来的实惠。
二、 对负隅顽抗及匪患，以“剿”为主，坚决武力清剿。
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