三日之后，内阁与兵部将旨意进一步完善，以六百里加急之速，密送辽东，至熊延弼之手。
熊延弼接此密旨，竟激动得浑身战栗，心中暗呼：“圣上知我意也！”
新旨意对辽东战略进行了一系列前所未有的大胆调整，亦标志着大明于辽东之战略，发生根本性转折。
一、战略转攻为守，确立“存人”之本
旨意开篇便直言不讳，首次以官方文件的形式承认：“朕观辽东战局，我军野战之力，实逊于建虏。” 这需要莫大的勇气，但也打破了以往“天朝上国”的虚骄之气。同时也明确提出了“存地失人，人地皆丢；存人失地，人地皆存”的十六字原则，规定今后辽东战事，“当以固守坚城、疲敌耗敌为主，非有万全把握，不得浪战。”
这一原则的确立，为后续所有军事调动提供了依据，也让前线的熊廷弼等松了一口气，不必再迫于朝中那些文官们的压力而仓促出战。
二、南军北调，拱卫京畿与编练新军
针对南方客军的调动是旨意的核心。文中详细阐述了理由：“川浙、湖广、广西等客军，忠勇可嘉，然北地苦寒，多生疾疫；更兼缺马少骑，机动不足，难以制衡虏骑。” 因此，决定将他们主动撤离辽东战场。
戚家军：移驻京师西山，其使命被提升到战略高度——“专司火器演训与新军编练”。这支有着辉煌传统和严明军纪的军队，即将成为了皇帝打造新型核心武装的“种子部队”。
白杆兵：移防天下第一关——山海关。他们不仅要负责关防，更重要的任务是“训导辽人新卒”，将其擅长的山地战法与北方士兵的特点结合，打造一支新的边防劲旅。
酉阳土司兵：驻防居庸关，扼守京师西北，严防蒙古部和建奴南下。
福建水师：调驻登州府，由新任登莱巡抚孙元化直接统领，打造新战船，编练新式水师，未来将会为辽东开辟水上战场，同时也将为辽东提供后勤保障。
其余南军：如广西狼兵、湖广兵等，均被安置在京师周边要害之地，构成了一道紧密的京畿防护圈。
此举一举三得：保全了南军精锐、增强了核心防卫力量、也开始了新军事改革的实践。
三、坚壁清野，釜底抽薪
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