如果说郑芝龙的崛起不是偶然，可是再看他在满清入关之后干的事就会感觉到他真的很离谱，甚至可以说是愚蠢了。
历史上1625年随着颜思齐和李旦两大海盗头目的先后离世，郑芝龙成功的接管了颜思齐和李旦二人在海上的势力，再加上日本幕府和澳门舅父黄程的支持，郑芝龙很快就打造出了一个北到日本，南到东南亚马六甲海峡，西至印度洋，中间还有台湾和福建作为基地的强大海上势力。
郑芝龙以台湾魍港为基地，经常攻占骚扰福建及广东数地，至1627年，已有船700艘，兵卒数万众，一跃成为当时明代海上最大的海盗集团。
然而这并不是他最辉煌的时候，在崇祯元年(1628年)九月，在同明朝政府经过了很长一段时间的拉扯，并感受到了明朝的诚意后，郑芝龙表示以剪除夷寇、剿平诸盗 为己任，归顺了明朝中央政府，诏授为福建巡抚熊文灿手下的五虎游击将军。
此时，郑芝龙已有部众3万余人，船只千余艘。
不过他还是最终在朝廷的诏令下离开台湾，坐镇闽海，为明廷守备沿海以防海盗倭寇和荷兰人进攻。
郑芝龙离开台湾，则使得荷兰人的势力逐渐在台湾变大，最终使得台湾的绝大多数地区都成为了荷兰的殖民地。
不过郑芝龙也没有因此而损失什么，反而而利用招安的机会，依靠明政府的授权和影响力，更加巧妙的整合了自己手下乃至东南地区各种力量，同时也充分吸取了荷兰海军技术，组建了一支更为强大的海洋舰队，可以说是能够同当时的欧洲殖民者一较长短，他的势力也达到了顶峰。
至于台湾对他而言不过是他众多海盗窝点中的一个而已，并没有什么大不了的。
而证明他达到顶峰的历史事件就是：在崇祯六年(1633年），郑芝龙亲率150多艘战舰，在着名的料罗湾海战中，大败不可一世的荷兰精锐舰队，将荷兰东印度公司舰队五艘巨舰一举击沉，“数十年未有之奇功”。这直接导致荷兰在东南亚洲的家底基本上全部报废，郑芝龙也凭此奠定了他绝对的海洋霸主地位。
此战过后二十年里，郑芝龙最盛时军力也扩张到了20多万的多国部队，均精习海战，拥有大小战船超过3000多艘，成为成为闽南的领主，可以说当时整个西太平洋广袤海域上最强霸主。无论是金钱数量、舰队数量，还是军队数量都远超当时的荷兰、西班牙、葡萄牙等殖民者。
甚至在1633年料罗湾海战后，郑芝龙控制东亚海域贸易，荷兰东印度公司也被迫每年向其进贡1000万法郎以换取航行安全
史载:凡海舶不得郑氏令旗者，不能来往。每舶例入三千金，岁入千万计，以此富敌国，自筑城安平镇从此海氛颇息，通贩洋货，内客外商，皆用郑氏旗号，无儆无虞，商贾有二十倍之利，芝龙尽以海利交通朝贵，寖以大显。
然而随着郑芝龙在海上势力的崛起和壮大，对应的则是明朝政府逐渐内忧外患中一步一步走向没落和灭亡。
作为明朝东南最大的海上势力，郑芝龙一系不仅没有给逐渐衰落的明朝提供支撑，反而还不断的吸血，甚至还通过海上贸易不断地给辽东的满清、闭关锁国的日本提供他们所急需的粮食、盐铁，乃至火器等战略物资。
最终在以郑芝龙等南方士绅的漠视下，大明崇祯十七年(1644年)，大明朝内外交困之下被李自成军攻破北京，崇祯皇帝于煤山自缢身亡。
随后，朱由崧被南方势力拥立为南明弘光皇帝，定都南京，扛起反清复明大旗。
而郑芝龙则被册封为南安伯，福建总镇，负责福建全省的抗清军务。
但另怀心思的郑芝龙、郑鸿逵兄弟，拥有强大的财力和军力，却依旧并未对弘光政权进行全力支持，反而是依旧眼睁睁地看着南明弘光政权被清军终结。仿佛养育他的家国跟其根本没有任何联系一样，就如同看一个陌生人的死亡那样的冷漠，甚至很有可能还在背后补了一刀。
弘光政权被清军终结之后，郑芝龙却由十分迅速的在福州公然支持明唐王朱聿键为帝，建立了隆武政权，并因功被册封为南安候，后又晋升平国公，加太师，成为福建南明政权的实际一号人物，权顷朝野。
但同时他的这一举动也导致大明在南方统治根基的分崩离析。
