户籍、赋税、科举、奴婢制度改革相继成功，大明社会面貌焕然一新，但司法制度的积弊仍在：司法腐败严重，官员收受贿赂、草菅人命；审判缺乏证据意识，多以刑讯逼供定罪，冤假错案频发；审判流程不透明，百姓申诉无门；缺乏专业的法医、证据鉴定人员，难以准确判断案件真相。这不仅让百姓怨声载道，更影响了社会的公平正义与稳定。
“司法公正是社会稳定的基石！” 张川在军机处直言，“如今其他制度均已改革，司法制度若仍固守旧制，只会让百姓失去对朝廷的信任，之前的改革成果也可能付诸东流。臣提议推行‘司法革新’，建立‘证据至上、公开审判、专业办案’的司法体系，打击司法腐败，平反冤假错案，保障百姓的合法权益。”
皇帝深表赞同：“司法腐败、冤假错案确实是朝廷的一大隐患。张爱卿，朕准你牵头司法革新，赋予你便宜行事之权，务必还大明一个清明司法！”
司法革新的核心在于 “公平、公正、公开”，具体方案有五：其一，建立 “证据制度”，明确审判以证据为核心，严禁刑讯逼供，证据不足不得定罪；其二，设立 “法医局”，由林雨柔培训专业法医，运用显微镜、灵植检测试剂等科技手段，进行尸体检验、物证鉴定；其三，推行 “公开审判”，除涉及国家机密、隐私的案件外，一律公开审理，允许百姓旁听、监督；其四，建立 “申诉制度”，百姓对判决不服，可向上级官府、刑部申诉，直至御前，确保申诉无门；其五，加强司法监督，设立 “御史监察院”，专门监督司法官员，打击司法腐败，对收受贿赂、草菅人命的官员，严惩不贷。
苏婉儿负责司法革新的制度建设与资金保障：“我已协调商盟，拨款二百万两白银，用于建设法医局、改善司法设施、培训司法人员；制定了详细的司法流程细则、证据标准、审判规范，确保各地司法机关操作统一、规范；建立了司法官员考核制度，将办案准确率、百姓满意度作为考核核心，考核不合格者一律免职。”
林雨柔负责法医局的建设与技术支持：“我已培训了千名专业法医，编写了《法医鉴定手册》，涵盖尸体检验、物证鉴定、毒物分析等多个领域；研发了多种司法检测技术，如显微镜观察微量物证（毛发、纤维、血迹）、灵植试剂检测毒物（可检测出百余种常见毒物）、指纹比对技术（用于身份识别、物证溯源）；批量生产了法医检测设备，分发到各地法医局，确保办案需要。”
赵灵儿负责司法监督与秩序维护：“我已带领玄甲卫，配合御史监察院，监督各地司法机关办案，打击司法腐败；保护法医、证人、申诉人的安全，防止不法分子报复；公开审理案件时，负责现场秩序维护，确保审判顺利进行；同时参与重大案件的侦破，运用军事侦查手段，协助寻找证据、抓捕真凶。”
司法革新的第一个重大成果，便是平反了轰动全国的 “江南书生冤狱”。江南一位书生，因与当地县令的儿子争夺才女，被县令诬陷盗窃官银、杀人灭口，屈打成招，判处死刑，秋后问斩。其家人四处申诉无门，得知司法革新后，向新设立的申诉机构提交了申诉材料。
张川接到申诉后，立刻下令重审此案，派林雨柔带领法医前往江南，重新检验证据。法医运用显微镜，发现案发现场的血迹并非书生所留，而是县令儿子的；通过灵植试剂检测，发现所谓的 “盗窃凶器” 上，没有书生的指纹，反而有县令儿子的指纹；结合证人证言（之前因害怕县令报复不敢作证，司法革新后敢于说实话），最终查明真相：是县令儿子盗窃官银、杀人灭口，县令为包庇儿子，诬陷了书生。
真相大白后，书生被无罪释放，县令父子被依法判处死刑，之前参与刑讯逼供、包庇的官员也被严惩。书生的家人跪在张川面前，哭着道谢：“张大人，若不是您推行司法革新，我儿恐怕早已含冤而死！您真是我们的再生父母！”
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