四架机甲和支援船立刻驶向礁石区。海底的凹陷约有半个篮球场大小，凹陷中央的礁石上，缠绕着大量银色的丝状物——它们比之前取样的丝更粗，像银色的藤蔓，相互交织，形成一张巨大的网，网的中心，隐约能看到淡金色的根须，从礁石缝隙里伸出来，和银纹丝紧紧相连。
“是生命之树的根系！”张师傅的声音从通讯器里传来，带着激动，“根须上的光纹和《超古代生命典籍》里的记载一模一样，能净化海水，还能滋养银纹丝！”
林峰操控神光者机甲靠近根须，机械爪轻轻举起营养液瓶，往根须上滴了几滴——淡金色的营养液刚接触根须，根须就发出更亮的光，银纹丝也跟着闪烁，像在回应。可就在这时，小夏的探测器突然报警：“有机械信号！在凹陷西侧的礁石后面，是星团评议会的微型侦察机械，三只！”
三只黑色的机械突然从礁石后窜出，直奔取样的基因保存盒——它们的体型像乒乓球，速度极快，嘴里还能喷出细小的暗能弹，试图破坏保存盒。
“拦住它们！”北斗的艾斯机甲立刻冲过去，细刃光刃横扫，切断了其中一只机械的动力线，机械瞬间失控，沉入海底。但另外两只机械绕过光刃，直奔神光者机甲的机械爪——保存盒就在爪上，一旦被暗能弹击中，样本就会被毁。
进次郎的初代机甲立刻展开光盾，挡住暗能弹，却被机械绕到侧面，眼看就要撞上保存盒。林峰咬了咬牙，按下神光者的紧急弹出按钮——驾驶舱盖弹开，他纵身跳出，双手举起神光棒，淡蓝色的光瞬间爆发，迪迦复合型的身影在凹陷上空展开。
“别想破坏样本！”迪迦的声音带着威严，双手凝聚冷冻光弹，对准两只机械——淡蓝色的光弹炸开，机械瞬间被冻成冰晶，沉入海底，暗能弹也被冻结在半空中，化作碎冰。
解决完机械，迪迦缓缓降落在礁石上，双手小心地护住生命之树的根须，防止战斗的余波伤害到它。接着，他切换成空中型，蓝紫色的身影掠过凹陷，确认没有其他机械残留后，才解除变身，化作蓝光融进林峰掌心。
林峰落在神光者机甲旁，接过七羽递来的热玉米馒头：“根须和银纹丝没事吧？没被战斗影响吧？”
“没事！”小夏的声音带着兴奋，“根须的活性更高了，迪迦的光之能量好像还滋养了它们！”
进次郎操控初代机甲，再次取样——这次，他用软质取样勺，小心地从根须上取了一小段，放进基因保存盒。“样本完好，”他对着通讯器说，“可以返回基地，让张师傅分析根须的基因序列，找生命之树的主遗迹！”
返航时，海面上的风渐渐小了，阳光透过海水，照在凹陷区的银纹丝上，泛着耀眼的银光。小夏趴在船边，在笔记本上飞快记录：“北湾探索成果：1清理玛格玛管道30米，灭活机械虫卵2枚；2发现银纹丝聚集区，采集样本3份；3获取生命之树根系样本1份；4击退星团评议会微型侦察机械3只——迪迦复合型冷冻机械，空中型确认安全，团队配合完美！”
七羽坐在旁边，给每个人分了热玉米馒头：“姑姑说这馒头加了红糖，抗饿还甜，大家多吃点，下午张师傅分析样本，咱们就能知道生命之树主遗迹的位置了！”
回到基地，张师傅早已在实验室等着，接过根须样本，立刻放进基因测序仪——屏幕上，根须的基因序列和超古代石碑的光纹能量完美匹配，测序仪还根据基因片段，模拟出生命之树主遗迹的大致位置：北湾深海沟，距离当前探索区5公里，深度80米。
“主遗迹就在那里！”张师傅激动地指着模拟图，“根须的生长方向都指向深海沟，那里应该有生命之树的主干，还有更多的超古代秘密！”
傍晚的食堂，姑姑端上了热气腾腾的红烧肉和蔬菜汤，大家围坐在餐桌旁，兴奋地讨论着明天的深海沟探索计划。小夏举着根须样本的照片，给大家讲解生命之树的净化功能；诸星弹和北斗在讨论明天机甲的深海耐压改装；进次郎则在查深海沟的地形资料；林峰和张师傅在研究基因序列，寻找遗迹的具体入口。
林峰喝着蔬菜汤，摸了摸胸口的神光棒——根须的温暖能量还在和棒身共鸣，像是在邀请他们去探索更深的秘密。他知道，生命之树的主遗迹不仅是超古代的宝藏，更是守护东京湾的新希望——它的净化能力，能让这片海变得更纯净，而它的秘密，或许能让他们更了解光之力量的本质。
实验室的灯光亮到很晚，张师傅在绘制深海沟探索路线图，小夏帮着整理基因数据，七羽在准备明天的深海物资（高压氧气瓶、深海保温服、更多的营养液），诸星弹和北斗在改装机甲的耐压涂层，进次郎则在调试深海探测器。
