奏疏最后强调：“此法此制，初行必有多艰。或有效率之虑，或有成本之增，或有番商之怨，或有吏员之弊。然安全乃通商之本，规矩乃长久之道。唯有以铁腕立规，以恒心推行，辅以清明吏治与公允执法，方能去莠存良，使海贸真正利国利民，成就万世不易之基。”
萧绝细细阅毕，拍案叫绝：“好！思虑周详，面面俱到！此乃治国安邦之良策！”他当即召集内阁重臣、六部尚书、及相关衙门主官，于次日举行紧急廷议。
廷议之上，叶悠悠的奏疏引发了激烈争论。
户部尚书首先担忧：“陛下，设立海关，增置官吏，修建馆舍设施，所费不赀。且检疫隔离，耽搁商船周转，恐影响关税收入，番商亦会怨言。”
礼部一位老臣则从“礼仪”角度反对：“陛下，天朝上国，怀柔远人。如此严查苛检，形同防贼，恐失藩属归化之心，有损陛下仁德圣名。”
亦有官员担心执行难：“如此繁琐章程，需大量熟谙事务之吏员。仓促之间，何处觅得？若所任非人，恐规矩未立，贪弊先生，反成笑柄。”
面对质疑，叶悠悠早已准备充分。她并未直接反驳，而是让萧宸将那名泉州役夫病愈后脸上疤痕的画像（经其同意），以及太医关于天花疫情一旦爆发可能造成后果的预估报告，传示众臣。
看着画中可怖的疤痕，听着太医描述的“十室九空”的可能惨状，刚才还言辞滔滔的官员们，不少都沉默了。
叶悠悠这才缓缓开口，声音清晰而坚定：“诸位大人所虑，皆有道理。然而，诸位居庙堂之高，可知民间一闻‘痘疮’，便是妻离子散、十室九空之惨景？今日侥幸，只一人染病，得控。若有朝一日，因查验不严，疫病传入，蔓延开来，届时损失的，岂是些许关税、些许番商好感所能比拟？那是万千百姓性命，是江山社稷之动荡！”
她目光扫过众人：“至于费用，海关运转后，规范征税，减少偷漏，长远必有益于国库。且初期可由内帑与市舶司收入支应，待步入正轨，以关税收支，足以自养还有盈余。”
“至于‘有损仁德’，”她语气转冷，“真正的仁德，是保护自己的子民免受无妄之灾！是对合法番商提供清晰、公平、安全的贸易环境！而非对潜在危险一味纵容，换来虚假的‘宽仁’之名！若因惧怕番商抱怨而置百姓安危于不顾，那才是最大的不仁！”
“至于吏员与执行，”叶悠悠语气稍缓，“万事开头难。可先从泉州试点，招募选拔，严格培训，以老带新。制定严明纪律与监察之法，重奖清廉能干者，严惩贪渎舞弊者。制度是死的，人是活的。只要朝廷决心坚定，监督有力，何愁不能推行？”
萧宸此时也出列表态：“儿臣以为，母后所言，乃老成谋国之道。安全为基，方有繁荣可言。儿臣愿请命，待泉州海关初成，前往学习观察，以明实务。”
太子的表态，加上皇帝明显倾向于皇后的态度，以及那幅触目惊心的画像，最终让反对声浪渐渐平息。经过整整一日的激烈辩论与细节推敲，《海关检疫通商疏》的核心内容，终获通过。
萧绝雷厉风行，当即下旨：任命郑和兼任首任“泉州海关监督”，全权负责海关筹建。拨内帑银八十万两作为启动资金。命吏部、户部、工部、太医署全力配合。并明诏天下，将建立海关、严查检疫之事公告，阐明为保护中外商民安全之苦心，安抚民心，震慑不法。
圣旨传出，有人振奋，有人忧疑，也有人暗中冷笑，准备看这“标新立异”的制度如何碰壁。
泉州港立刻开始了热火朝天的建设。检疫区扩建，审查厅、税务司衙署拔地而起，专门的消毒房、隔离房、扣押仓库相继建成。郑和从市舶司原有人员、医塾学员、当地招募的识字青年中，选拔出第一批海关吏员，进行紧急培训。叶悠悠亲自编写了简易的《检疫要点》《常见违禁品图谱》作为教材。
一个月后，大燕第一座具备现代海关雏形的机构——泉州海关，正式挂牌运作。所有进入泉州港的外来船只、人员、货物，必须接受其统一管理。
新制度运行之初，果然遇到了预料中的麻烦。
一些番商抱怨手续繁琐，耽搁时间，影响他们抢购紧俏商品。个别番商试图以“误了船期损失巨大”为由，要求通融，甚至私下向海关吏员塞钱。
这一日，一名大食商人带着几箱自称是“上等香料”的货物报关。审查厅的小吏按要求开箱查验，发现香料下面，赫然藏着几十把制作精良、明显超出“自卫”范畴的短刃弯刀！这是明令禁止夹带的武器！
小吏立刻上报。那大食商人顿时变脸，先是以重金贿赂，被严词拒绝后，竟纠集同船水手，在海关衙署外鼓噪喧哗，声称海关故意刁难，损坏其货物，要讨说法。甚至引来了一些不明真相、本就对严格检查心怀不满的其他番商围观附和，场面一度有些混乱。
